保密协议中违约责任的条款约定应当注意以下几个问题：

    1、可以考虑针对用人单位与劳动者违约设置不同的违约责任种类。违约责任包括：继续履行、采取补救措施、违约金给付和赔偿损失。

    2、违约责任的情形应当明确。即应当明确出现哪些情形是违约行为，对于保密协议的违约责任来说，应当尽可能做到多多列举。

    3、如果违约责任的承担方式是违约金的话，则违约金的数额应当明确。

    4、建议用人单位设置违约金和赔偿损失的双重条款。这样一来，一旦出现违约金的数额尚不足以弥补用人单位损失的情况，用人单位仍然可以主张劳动者给付实际损失与违约金之间的差额。